北京市第六医院前身为美国基督教长老会于1885年创办的“妇婴专科医院”,1917年更名为“道济医院”,1952年被北京市人民政府接管,命名为“北京市第六医院”至今,已有131年的历史。一批**的专家、学者曾在我院任职,如:协和医院**妇产科专家林巧稚曾在我院工作并任董事会成员;原中国医科院院长、协和医院大内科主任邓家栋曾任我院内科主任;我国泌尿外科奠基人、友谊医院泌尿外科主任于惠元曾任我院外科主任等。
经过131年的锤炼,医院已经成为一所学科专业齐全、技术力量雄厚、服务水平较高、设备先进、综合实力较强,集临床、科研、教学、预防、公共卫生为一体的二级甲等综合性医院,承担着地区近60万人的医疗、预防、保健任务及外省市医疗单位的会诊、接诊任务。是北京协和医院、北京安贞医院、中日友好医院呼吸及疼痛专科的医联体成员单位。
在东城区“十二五”卫生发展规划中,医院被确定为东城区区域医疗中心。近年来,在东城区委、区政府和东城区卫计委的关怀下,医院确定了“立足东城,带动基层,努力建设成具有三级综合医院技术水平、能够引领带动区域医疗持续发展的东城区区域医疗中心”的123发展战略。